一、按用途分类
按用途可分为两大类：
（1）工业洁净室。以无生命的微粒作为控制对象。主要控制无生命微粒对工作对象的污染，内部一般保持正压。它适用于精密工业、电子工业、宇航工业、原子能工业、印刷工业、照相工业等部门。
（2）生物洁净室。以有生命的微粒为控制对象，又可分为：
①一般生物洁净室。主要控制有生命微粒对工作对象的污染。同时内部材料要经受各种灭菌剂侵蚀，内部一般保持正压。可用于制药工业、食品工业、医疗设施、实验设施等
②生物安全洁净室。主要控制工作对象的有生命微粒对外界和人的污染，内部需保持负压。用于实验设施、生物工程、医疗设施等。
二、按气流分类
按气流可分为四类：
⑴单向流洁净室
⑵非单向流洁净室（乱流洁净室）
⑶矢角流洁净室
⑷混合流洁净室（局部单向流洁净室）
